Lipsa de somn este percepută de corp ca un factor de stres. Chiar și câteva nopți de somn insuficient pot activa axa HPA și pot crește nivelul de cortizol, mai ales seara, când în mod normal ar trebui să fie scăzut. Practic, corpul intră într-o stare de alertă, ca și cum ar trebui să rămână vigilent, nu să se refacă. În timp, acest lucru dereglează ritmul natural al cortizolului: dimineața poate fi prea scăzut, iar seara prea ridicat, ceea ce întreține oboseala, anxietatea și dificultatea de a adormi.